Компания, располагающая четырьмя самолетами Ту-154, должна не менее 50 миллионов рублей, большую часть которых - московскому аэропорту Домодедово. Среди других кредиторов - аэропорты Сочи и Новокузнецка, а также Росаэронавигация, которой компания должна за услуги по аэронавигационному обеспечению полетов. Ряд аэропортов отказались обслуживать самолеты компании. Летом "Заполярье" выполнило с серьезными опозданиями (более 2 часов) 26% рейсов. В последнее время компания занималась в основном курортными перевозками в небольших объемах.